Seit Beginn der Spielzeit 2018/2019 ist Marko Letonja Generalmusikdirektor und Chefdirigent der Bremer Philharmoniker. Zudem steht er seit 2012 an der Spitze des Orchestre Philharmonique de Strasbourg, mit dem er international durch Tourneen und Gastspiele – unter anderem in Deutschland und Südkorea – auf sich aufmerksam machte und 2019 den Grand Prix für die beste Opernproduktion des Syndicat Professionnel de la Critique gewann.

Marko Letonja ist außerdem Artistic Director des Tasmanian Symphony Orchestra, dessen Chefdirigent er von 2011 bis 2018 war. In dieser Zeit führte er das Orchester zu einem neuen künstlerischen Niveau; 2017 wurde er dafür mit dem Helpman Award für das beste Konzert eines Sinfonieorchesters ausgezeichnet.

Als Gastdirigent arbeitet Letonja mit renommierten Orchestern wie den Wiener Symphonikern, den Münchner Philharmonikern, dem Orchestre de la Suisse Romande, den Hamburger Symphonikern und dem Orchestra Filarmonica della Scala in Mailand sowie dem Rundfunk-Sinfonieorchester Berlin zusammen. Weitere Engagements verbinden ihn mit dem Seoul Philharmonic Orchestra, dem Mozarteumorchester Salzburg, dem Königlichen Opernorchester Stockholm, dem Staatsorchester Stuttgart und dem Orchestra Sinfonica di Milano Giuseppe Verdi. Regelmäßig ist er zudem an Opernhäusern in Wien, Genf, Rom, Dresden, Berlin, München und Lissabon zu Gast. Auch in Australien und Neuseeland ist er präsent; 2008 wurde er zum Principal Guest Conductor des Orchestra Victoria Melbourne ernannt.

Letonja studierte Klavier und Dirigieren an der Musikakademie in Ljubljana und setzte seine Ausbildung an der Universität für Musik und darstellende Kunst Wien fort, wo er 1989 abschloss. Bereits zwei Jahre später wurde er Musikdirektor der Slowenischen Philharmonie in Ljubljana, die er bis zu seiner Ernennung zum Chefdirigenten und Musikdirektor des Sinfonieorchesters und des Theaters Basel leitete. In dieser Zeit begann auch seine internationale Laufbahn als Konzertdirigent.